More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1008 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  100 
 
 
181 aa  366  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  58.94 
 
 
176 aa  178  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1845  serine acetyltransferase-like protein  59.87 
 
 
164 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  59.87 
 
 
163 aa  174  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1371  Serine acetyltransferase-like  58.55 
 
 
169 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105328  normal  0.270521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.37 
 
 
175 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.52 
 
 
175 aa  97.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.22 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  39.39 
 
 
195 aa  91.3  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  50.52 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  38.75 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  40.28 
 
 
245 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  40.28 
 
 
245 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  38.46 
 
 
249 aa  87.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  38.24 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  45.71 
 
 
275 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  45.54 
 
 
268 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0561  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.91 
 
 
204 aa  84.3  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.740999  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  41.91 
 
 
249 aa  84.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  36.57 
 
 
247 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  41.91 
 
 
264 aa  84  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  39.72 
 
 
280 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0927  serine O-acetyltransferase  44.12 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  38.52 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  46.53 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3570  Serine acetyltransferase-like protein  45.13 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220057  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1731  Serine acetyltransferase  37.98 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0728275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1230  Serine O-acetyltransferase  39.22 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1217  Serine acetyltransferase  35.66 
 
 
246 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4306  serine O-acetyltransferase  41.86 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  46.23 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  41.48 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
176 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01521  Serine acetyltransferase  41.28 
 
 
247 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18291  Serine acetyltransferase  44.12 
 
 
244 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.095419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  44.04 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  33.73 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  36.84 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  35.1 
 
 
243 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  41.96 
 
 
240 aa  80.9  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1733  Serine O-acetyltransferase  40.31 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  38.82 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  37.06 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  38.71 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2254  serine O-acetyltransferase  45.83 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000404898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  45.28 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  40.83 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  36.88 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18481  Serine acetyltransferase  37.21 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4354  hypothetical protein  47.25 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.372649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  45.54 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0082  serine O-acetyltransferase  37.3 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20921  Serine acetyltransferase  34.72 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.869506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1261  Serine acetyltransferase-like  40 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4294  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.25 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0896  serine O-acetyltransferase  44.66 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0394275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3953  Serine O-acetyltransferase  38.06 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0171272  hitchhiker  0.00273394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12330  serine O-acetyltransferase  42.06 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.369059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.65 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  36.55 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  44 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  46.53 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  35.53 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  35.14 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  41.38 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  33.54 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  37.29 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  39.52 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  38.6 
 
 
273 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  37.29 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  37.76 
 
 
222 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  45.54 
 
 
258 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  41 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  37.09 
 
 
254 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  39.26 
 
 
241 aa  77.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00666  serine acetyltransferase  39.47 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  39.32 
 
 
228 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  42.15 
 
 
262 aa  77.4  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  36.09 
 
 
273 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.22 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4791  serine O-acetyltransferase  45.1 
 
 
213 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312597  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  38.85 
 
 
255 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  40.37 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  37.07 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1389  serine O-acetyltransferase  41.96 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.0958041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12359  serine acetyltransferase cysE  40 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  44.55 
 
 
258 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3701  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  37.1 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0595  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  33.57 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  42.55 
 
 
258 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  37.07 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  37.07 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  40.37 
 
 
258 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  37.14 
 
 
230 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  37.07 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  43.12 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  37.14 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  32.52 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>