16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0679 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  46.15 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  40.24 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  41.86 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  41.56 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  43.75 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  36.25 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  41.03 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  33.33 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  43.21 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  34.58 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  36.27 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  33.65 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  36.08 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>