214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8059 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8059  transposase  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  99.19 
 
 		 124 aa  243  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  99.19 
 
 		 124 aa  243  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  91.13 
 
 		 124 aa  225  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  73.98 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  73.17 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  73.17 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  72.36 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  72.36 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  72.36 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  72.36 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  72.36 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  71.54 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  71.54 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  71.54 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  76.67 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  76.67 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  73.77 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  75.21 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  70.83 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  71.19 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  68.25 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  76.85 
 
 		 109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  66.09 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  63.46 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  63.46 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  63.46 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  63.46 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  71.88 
 
 		 99 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  89.23 
 
 		 71 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  66.18 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  75.44 
 
 		 57 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  77.19 
 
 		 57 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  61.54 
 
 		 53 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  62.26 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  41.76 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  33.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  34.44 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  34.44 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  34.44 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  34.44 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  34.41 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  34.41 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  32.98 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  75 
 
 		 43 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  35.11 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  27.55 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  27.55 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  27.55 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  34.04 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  34.04 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  32.22 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  31.91 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  29.03 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  34.07 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1618  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0065  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  27.78 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>