31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2838 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  100 
 
 
88 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  69.05 
 
 
84 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4564  prevent-host-death family protein  64.29 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  58.33 
 
 
84 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  54.22 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  54.22 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  54.22 
 
 
83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2040  prevent-host-death family protein  51.19 
 
 
84 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1398  prevent-host-death protein  57.33 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000552263  normal  0.0192165 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  61.64 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  61.64 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0680  prevent-host-death protein  50 
 
 
84 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219164  normal  0.89049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3417  prevent-host-death protein  51.85 
 
 
83 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531157  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  50 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  56.52 
 
 
84 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2000  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0919472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1389  prevent-host-death family protein  50.59 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5182  prevent-host-death family protein  46.59 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104067  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  52.56 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3557  prevent-host-death family protein  48.53 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  43.4 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  37.1 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4109  hypothetical protein  61.29 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  36.51 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4743  prevent-host-death family protein  39.58 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5328  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14719  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0497  putative prevent-host-death protein  39.22 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5802  prevent-host-death family protein  39.22 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  hitchhiker  0.00969528 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>