31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1322 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  54.59 
 
 		 195 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  51.53 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  51.53 
 
 		 195 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  44.04 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  44.04 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  44.74 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  37.57 
 
 		 194 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  37.56 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  38.14 
 
 		 192 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  37.56 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  36.27 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  39.02 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  37.13 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  33.5 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  37.8 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  35.37 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  36.61 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  34.66 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  34.57 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  35.98 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  38.26 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  32.81 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  27.55 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  30.64 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  32.26 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  31.53 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.65 
 
 		 472 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  32.65 
 
 		 465 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>