More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0617 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  100 
 
 		 469 aa  952    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  56.96 
 
 		 485 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  57.48 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  58.1 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  57.11 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  56.49 
 
 		 486 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  54.29 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  52.97 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 		 469 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  45.77 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  42.74 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  39.83 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 		 479 aa  326  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  35.95 
 
 		 472 aa  322  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1751  serine/threonine protein kinase  41.79 
 
 		 214 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.868443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.48 
 
 		 641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 		 636 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.18 
 
 		 584 aa  133  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.13 
 
 		 598 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 862 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.79 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 650 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.3 
 
 		 632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 691 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 612 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.38 
 
 		 692 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 746 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 468 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.42 
 
 		 667 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.04 
 
 		 715 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  34.19 
 
 		 1018 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.11 
 
 		 863 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 		 368 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 1479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  36.6 
 
 		 661 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  33.46 
 
 		 1032 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.93 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.68 
 
 		 747 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 678 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 894 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  30.69 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.42 
 
 		 728 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  29.32 
 
 		 692 aa  118  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  30.94 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  33.46 
 
 		 1032 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.76 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.12 
 
 		 604 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.48 
 
 		 638 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.59 
 
 		 627 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  31.16 
 
 		 1053 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 		 464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 582 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.37 
 
 		 645 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 		 938 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.5 
 
 		 822 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.43 
 
 		 798 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.11 
 
 		 681 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.37 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  33.33 
 
 		 736 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 1415 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 915 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  32.43 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  30.69 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  33.69 
 
 		 556 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.52 
 
 		 625 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.9 
 
 		 737 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.46 
 
 		 1110 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 464 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.95 
 
 		 593 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  30.96 
 
 		 617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 1774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  30.22 
 
 		 579 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.26 
 
 		 621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  29.52 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 754 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.81 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  30.94 
 
 		 556 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  32.46 
 
 		 618 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 		 615 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 891 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.97 
 
 		 700 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  33.33 
 
 		 519 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 577 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 1340 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 562 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.65 
 
 		 916 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.15 
 
 		 662 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.41 
 
 		 587 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>