188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0021 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0005  tRNA-Thr  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0029  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0048  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000131085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0047  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0896302 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0024  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0700552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0053  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0003  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.119632  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0064  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00380472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0065  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00366622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0067  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00910637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0104  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000123497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0763298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0436606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0097  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000407558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0112  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00108  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166673  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0089  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0276092  hitchhiker  0.00000375071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0085  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0231321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0086  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>