230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4087 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  100 
 
 
328 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  65.62 
 
 
329 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  65.62 
 
 
329 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  65.62 
 
 
329 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  62.58 
 
 
318 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  60.43 
 
 
349 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  65.62 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  60.5 
 
 
325 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  54.41 
 
 
343 aa  348  9e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  53.77 
 
 
326 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  49.53 
 
 
321 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  49.84 
 
 
326 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  47.45 
 
 
321 aa  300  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  50.63 
 
 
320 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  50.31 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  50.31 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  49.69 
 
 
320 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  45.77 
 
 
325 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  44.51 
 
 
321 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  43.25 
 
 
334 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  45.74 
 
 
343 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  45.43 
 
 
343 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  42.73 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  39.88 
 
 
335 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  39.63 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.12 
 
 
332 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  40.61 
 
 
329 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  40.96 
 
 
332 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  38.3 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  40.06 
 
 
318 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  39.38 
 
 
329 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.91 
 
 
329 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.13 
 
 
318 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.44 
 
 
318 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  38.91 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.8 
 
 
333 aa  212  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  39.18 
 
 
321 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.27 
 
 
318 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  38.7 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  41.01 
 
 
319 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  36.56 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  36.25 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  38.02 
 
 
320 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.94 
 
 
322 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.11 
 
 
321 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  36.11 
 
 
334 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  36.78 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.85 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  36.7 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  37.5 
 
 
328 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  35.31 
 
 
321 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  32.62 
 
 
342 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  35.29 
 
 
322 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  37.08 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  36.78 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  36.78 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.78 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
320 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.25 
 
 
325 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  33.64 
 
 
320 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.83 
 
 
321 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  33.02 
 
 
503 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.02 
 
 
339 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  34.35 
 
 
331 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  31.72 
 
 
336 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  32.3 
 
 
338 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.11 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  29.22 
 
 
338 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  30.93 
 
 
325 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  30.15 
 
 
336 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  32.58 
 
 
322 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  30.06 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  30.65 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.02 
 
 
331 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.94 
 
 
342 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  28.57 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  29.46 
 
 
336 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  29.46 
 
 
336 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  29.46 
 
 
336 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  29.34 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  30.79 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.12 
 
 
331 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  38.17 
 
 
360 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  34.75 
 
 
330 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  46.32 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0241  luciferase family protein  30.68 
 
 
274 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  28.03 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  34.53 
 
 
417 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1500  alkanesulfonate monooxygenase  28.36 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  25.81 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  32.56 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  32.76 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.32 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  26.44 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.12 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  26.32 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3110  luciferase family protein  25.47 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.863078  normal  0.0344353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>