33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3252 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3252  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36510  predicted GTPase, G3E family  32.18 
 
 
369 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.989507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0158  cobalamin synthesis CobW domain protein  31.4 
 
 
364 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2902  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  29.31 
 
 
427 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3858  cobalamin synthesis CobW domain protein  28.26 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0342119  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0288  cobalamin synthesis CobW domain protein  33.15 
 
 
603 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.320141  normal  0.0218664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4195  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  26.86 
 
 
426 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.393876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3290  cobalamin synthesis CobW domain protein  29.29 
 
 
405 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.565561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3859  cobalamin synthesis CobW domain protein  26.16 
 
 
350 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0885054  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2856  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  50.98 
 
 
436 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221886  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  23.5 
 
 
402 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  23.64 
 
 
400 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3371  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  30.92 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  23.64 
 
 
400 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  24.2 
 
 
417 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.67 
 
 
400 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.67 
 
 
400 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  26.25 
 
 
423 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  27 
 
 
377 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  24.65 
 
 
403 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  23.53 
 
 
408 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  20.71 
 
 
395 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  20.51 
 
 
527 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  24.36 
 
 
423 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  26.73 
 
 
422 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  21.48 
 
 
395 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  25.6 
 
 
402 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  24.36 
 
 
423 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4818  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  25.87 
 
 
395 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0671269  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  20.71 
 
 
395 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4732  cobalamin synthesis CobW-like protein  25.87 
 
 
395 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  21.96 
 
 
402 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  20.71 
 
 
395 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>