More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0644 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0644  acetate kinase  100 
 
 
389 aa  806    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.461739  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  47.88 
 
 
406 aa  360  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46 
 
 
398 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  46.25 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.75 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  44.84 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.97 
 
 
399 aa  355  5e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.25 
 
 
398 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  46.73 
 
 
397 aa  353  4e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  45.73 
 
 
395 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  46.15 
 
 
403 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  42.93 
 
 
394 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  46.15 
 
 
403 aa  348  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  46.13 
 
 
399 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  45.5 
 
 
408 aa  345  7e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  46.37 
 
 
401 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.15 
 
 
406 aa  343  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  45.14 
 
 
405 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  44.47 
 
 
397 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  45.09 
 
 
414 aa  338  7e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  45.11 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  45.45 
 
 
397 aa  336  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  42.96 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.06 
 
 
397 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  45.59 
 
 
404 aa  332  8e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  45.29 
 
 
402 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.47 
 
 
401 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  45.69 
 
 
396 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  44.7 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  44.25 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1870  acetate kinase  42.5 
 
 
401 aa  327  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  45.29 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0722  acetate kinase  44.19 
 
 
409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0141081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  43.58 
 
 
397 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.53 
 
 
397 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  44.19 
 
 
399 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  41.75 
 
 
404 aa  322  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  45.06 
 
 
409 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  43.22 
 
 
399 aa  320  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0623  acetate kinase  44.13 
 
 
409 aa  320  3e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  41.81 
 
 
399 aa  320  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  42.25 
 
 
404 aa  319  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  44.27 
 
 
395 aa  319  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  43 
 
 
396 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  43.42 
 
 
403 aa  316  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  43.77 
 
 
397 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  43.77 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  44.25 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  43.07 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  43.51 
 
 
397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  43.26 
 
 
397 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  42.68 
 
 
398 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  41.34 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  42.75 
 
 
402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  39.95 
 
 
406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  42.89 
 
 
399 aa  308  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08760  acetate kinase  42.42 
 
 
403 aa  308  8e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  42.93 
 
 
386 aa  308  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  40.95 
 
 
398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  42.89 
 
 
397 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  43.33 
 
 
417 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  40.9 
 
 
421 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  41.37 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  42.78 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  42.78 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  42.89 
 
 
394 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01770  acetate kinase  43.24 
 
 
388 aa  302  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  43.58 
 
 
397 aa  300  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  40.86 
 
 
399 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  40.6 
 
 
420 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  40.81 
 
 
396 aa  298  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  42.57 
 
 
394 aa  298  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  41.98 
 
 
401 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  39.75 
 
 
398 aa  296  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  41.98 
 
 
395 aa  296  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  41.11 
 
 
419 aa  296  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  41.33 
 
 
411 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  42.49 
 
 
380 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  40.81 
 
 
396 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  39.95 
 
 
400 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  0.00000356853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  41.71 
 
 
403 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  40.55 
 
 
396 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  41.04 
 
 
421 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  40.66 
 
 
417 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  40 
 
 
421 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  39.24 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  40.92 
 
 
395 aa  289  7e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  39.85 
 
 
422 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  39.85 
 
 
410 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  40.9 
 
 
421 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  39.85 
 
 
410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  39.43 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  38.58 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>