More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0346 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  100 
 
 
400 aa  829    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  0.00000356853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  72.36 
 
 
410 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  72.29 
 
 
410 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  52.14 
 
 
394 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  51.89 
 
 
394 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  51.15 
 
 
395 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  46.94 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  50.13 
 
 
394 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  46.9 
 
 
399 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  46.94 
 
 
398 aa  349  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  46.65 
 
 
399 aa  349  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  50.13 
 
 
399 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  46.9 
 
 
399 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  46.9 
 
 
399 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  46.39 
 
 
393 aa  346  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  47.59 
 
 
398 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  46.82 
 
 
400 aa  346  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  46.94 
 
 
398 aa  346  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.65 
 
 
399 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  46.15 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  46.08 
 
 
412 aa  342  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  46.15 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  46.15 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  46.15 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  46.15 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  46.02 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  46.48 
 
 
398 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  49.37 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  44.96 
 
 
398 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  45.54 
 
 
398 aa  335  7e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.8 
 
 
413 aa  335  9e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  45.89 
 
 
405 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  44.81 
 
 
401 aa  332  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  44.19 
 
 
395 aa  332  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  42.89 
 
 
398 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  45.61 
 
 
411 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  44.67 
 
 
403 aa  330  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  42.64 
 
 
398 aa  328  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  45.27 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  44.06 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.36 
 
 
398 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  43.81 
 
 
398 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  46.57 
 
 
397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  43.11 
 
 
399 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  43.78 
 
 
403 aa  324  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  43.78 
 
 
403 aa  324  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  43.6 
 
 
402 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  44.76 
 
 
398 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  45.3 
 
 
408 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  43.36 
 
 
397 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44.05 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  45.5 
 
 
402 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  47.5 
 
 
414 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  47.5 
 
 
414 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  47.5 
 
 
414 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43.24 
 
 
404 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  46.58 
 
 
405 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  42.25 
 
 
422 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  42.21 
 
 
394 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  43.25 
 
 
398 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  44.81 
 
 
449 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  44.03 
 
 
406 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  42.64 
 
 
397 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  45.36 
 
 
400 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  42.61 
 
 
396 aa  315  7e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  45.36 
 
 
400 aa  315  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  45.36 
 
 
400 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  42.61 
 
 
396 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  42.61 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  44.7 
 
 
396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  46.75 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  43.67 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.3 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  42 
 
 
401 aa  312  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  44.61 
 
 
397 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  44.25 
 
 
425 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  43.25 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  44.25 
 
 
425 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  44.47 
 
 
421 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  43.99 
 
 
415 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  42.39 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  42.96 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  44.36 
 
 
398 aa  309  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  42.78 
 
 
411 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  42.14 
 
 
417 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  41 
 
 
396 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  43.47 
 
 
397 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  39.85 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  43.75 
 
 
400 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  41.87 
 
 
400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  43.22 
 
 
400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  41.75 
 
 
399 aa  306  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  41.25 
 
 
394 aa  306  6e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  43.98 
 
 
399 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  42.71 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  42.36 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0856  acetate kinase  43.63 
 
 
409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00408014  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  44.33 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  43.15 
 
 
380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  43.54 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>