More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0856 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0856  acetate kinase  100 
 
 
409 aa  808    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00408014  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  50.37 
 
 
398 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  48.54 
 
 
398 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  52.62 
 
 
395 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  51.37 
 
 
394 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  49.62 
 
 
425 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  50 
 
 
415 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  48.26 
 
 
401 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  49.37 
 
 
425 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  45.23 
 
 
395 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  47.56 
 
 
398 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  44.39 
 
 
397 aa  349  6e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  49.88 
 
 
394 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  47.16 
 
 
399 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  48 
 
 
411 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  45.23 
 
 
399 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  49.63 
 
 
394 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  52.75 
 
 
405 aa  343  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.92 
 
 
397 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  46.65 
 
 
400 aa  342  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.45 
 
 
399 aa  342  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.39 
 
 
413 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  45.97 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  45.19 
 
 
396 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  44.58 
 
 
397 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  45.23 
 
 
398 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  46.15 
 
 
398 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  46.21 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  46.21 
 
 
399 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  44.91 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  44.67 
 
 
397 aa  338  7e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  44.99 
 
 
399 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  44.99 
 
 
399 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  44.67 
 
 
397 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  44.99 
 
 
399 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  44.99 
 
 
399 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  47.15 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  44.31 
 
 
396 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  46.9 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  44.42 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  47.88 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  45.23 
 
 
400 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  43.73 
 
 
404 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  44 
 
 
398 aa  332  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  43.52 
 
 
406 aa  330  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  43.81 
 
 
397 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  43.61 
 
 
417 aa  328  7e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  50.37 
 
 
399 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  44.91 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  43.2 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  42.96 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  44.04 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  50.24 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  45.19 
 
 
403 aa  327  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  45.3 
 
 
403 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  43.73 
 
 
399 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  43.24 
 
 
405 aa  326  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  42.07 
 
 
393 aa  326  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  46.53 
 
 
398 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.34 
 
 
398 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  48.03 
 
 
409 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  42.46 
 
 
400 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  42.46 
 
 
400 aa  323  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  45 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  44.99 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  45 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  45 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  45 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  45 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  41.91 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  42.36 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  41.53 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  44.31 
 
 
421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  43.41 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  43.28 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  44.75 
 
 
402 aa  319  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  44.75 
 
 
402 aa  319  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  45.79 
 
 
380 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  42.16 
 
 
397 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1591  acetate kinase  49 
 
 
396 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390767  normal  0.0967688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  44.12 
 
 
398 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  44.5 
 
 
402 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4051  acetate kinase  46.13 
 
 
411 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  46.38 
 
 
403 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  43 
 
 
412 aa  316  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  44.5 
 
 
402 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  42.48 
 
 
414 aa  315  7e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  42.86 
 
 
397 aa  315  8e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  47.55 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  41.32 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  50.25 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4009  acetate kinase  46.13 
 
 
411 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  44.91 
 
 
400 aa  309  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>