57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0188 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 508 aa  1031    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03840  putative collagen-binding protein  36.67 
 
 		 607 aa  250  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.173471 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.9 
 
 		 1019 aa  229  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  27.78 
 
 		 883 aa  87.8  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  24.4 
 
 		 963 aa  69.3  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  40 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  36 
 
 		 969 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  36 
 
 		 969 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  44.3 
 
 		 1508 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36 
 
 		 971 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  36.56 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  41.18 
 
 		 1108 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  43.04 
 
 		 1112 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  34.45 
 
 		 1307 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  37.63 
 
 		 1328 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  34.41 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  29.94 
 
 		 627 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  39.66 
 
 		 1266 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  32.07 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0966  collagen adhesin domain-containing protein  20.3 
 
 		 982 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  34.29 
 
 		 1093 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  36.36 
 
 		 853 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  31.18 
 
 		 718 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  34.29 
 
 		 1055 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  30.18 
 
 		 714 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  36.19 
 
 		 1888 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  29.34 
 
 		 718 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  22.57 
 
 		 3393 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  28.74 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  28.14 
 
 		 718 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  28.74 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  40.22 
 
 		 724 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  34.29 
 
 		 1093 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  33.67 
 
 		 975 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  21.11 
 
 		 3190 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2525  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 		 961 aa  50.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2577  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 		 961 aa  50.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.45 
 
 		 2179 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5205  collagen adhesion protein, N-terminus  22.08 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  22.4 
 
 		 3486 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  22.08 
 
 		 3333 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.65 
 
 		 939 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.21 
 
 		 3210 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  37.08 
 
 		 2272 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  38.24 
 
 		 3392 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  38.24 
 
 		 3242 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  38.03 
 
 		 1804 aa  47.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  34 
 
 		 913 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1487  Cna B domain protein  31.03 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  29.47 
 
 		 901 aa  46.6  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  35.96 
 
 		 2136 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  35.16 
 
 		 4881 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  34.21 
 
 		 4909 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  36.36 
 
 		 725 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  32.61 
 
 		 771 aa  44.3  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  36.14 
 
 		 1888 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  33.33 
 
 		 882 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>