49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1849 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 302 aa  597  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  38.11 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  40.07 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  40.44 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  37.77 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  39.26 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  37.91 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.26 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  36.76 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  36.46 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  36.46 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.46 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.69 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  36.46 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.69 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  37.32 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.69 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.36 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.1 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.2 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.97 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  35.56 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  39.08 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  35.04 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.31 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  38.62 
 
 		 265 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  35.66 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  39.93 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  35.89 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.23 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.23 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  36 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  35.5 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.92 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.68 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  34.41 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.87 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.32 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  34.41 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.68 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  33.92 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.51 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.51 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  33.68 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.83 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.31 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>