62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0085 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0085  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.171422  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
66 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  35.38 
 
 
347 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
73 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  33.85 
 
 
67 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3071  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 
75 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  40.62 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  35.06 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  42.59 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  34.38 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.77 
 
 
67 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  31.43 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
66 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
66 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.12 
 
 
66 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
66 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 
68 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
66 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.06 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  33.85 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  35.94 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  21.25 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  40.38 
 
 
70 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.14 
 
 
73 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>