20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6402 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  51.74 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  39.3 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  42.29 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  39.68 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  41.73 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  29.76 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  29 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  30.2 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  28.85 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  32.24 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  30.08 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  29.44 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  26.61 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30840  hypothetical protein  29.67 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6898  hypothetical protein  31.22 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3645  hypothetical protein  24.35 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39460  hypothetical protein  25.39 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13901  hypothetical protein  25.33 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>