More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3581 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3581  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
488 aa  934    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00918091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0357  amino acid adenylation domain-containing protein  62.6 
 
 
490 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  normal  0.469317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  40.12 
 
 
5467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  36.16 
 
 
3761 aa  282  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  45.01 
 
 
559 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  39.71 
 
 
2187 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  41.3 
 
 
3224 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  37.1 
 
 
2561 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  41.06 
 
 
2125 aa  276  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.53 
 
 
2352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  37.4 
 
 
2151 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  39.43 
 
 
1769 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  42.12 
 
 
7541 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  37.2 
 
 
1498 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  35.32 
 
 
1454 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  43.5 
 
 
1726 aa  269  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  38.83 
 
 
6271 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  39.03 
 
 
6272 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  37.09 
 
 
3432 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  38.83 
 
 
6274 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  36.25 
 
 
4037 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3874  amino acid adenylation domain protein  41.13 
 
 
1665 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0218124 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  40.86 
 
 
1130 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  41.6 
 
 
1083 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  34.02 
 
 
5738 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.29 
 
 
2033 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  35.64 
 
 
7168 aa  266  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.5 
 
 
4502 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  39.11 
 
 
3227 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  40.79 
 
 
1074 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  39.02 
 
 
3219 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  39.34 
 
 
4318 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  39.31 
 
 
3227 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  35.85 
 
 
2883 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  39.39 
 
 
3221 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37.47 
 
 
4747 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  40.51 
 
 
2333 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  35.57 
 
 
2846 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  33 
 
 
1449 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.89 
 
 
2154 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  40.69 
 
 
8211 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.64 
 
 
3235 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  35.25 
 
 
4960 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  39.18 
 
 
3231 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  39.18 
 
 
3231 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.82 
 
 
1714 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.51 
 
 
1789 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  39.63 
 
 
1315 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  32.18 
 
 
1078 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  37.8 
 
 
8915 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.63 
 
 
3176 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  35.9 
 
 
5654 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.66 
 
 
2606 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  34.24 
 
 
1345 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  39.63 
 
 
599 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.83 
 
 
9498 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  40.16 
 
 
4489 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  39.36 
 
 
1129 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  34.85 
 
 
1553 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  31.35 
 
 
1439 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  41.53 
 
 
3018 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.07 
 
 
8914 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  33.93 
 
 
2164 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.02 
 
 
3470 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.73 
 
 
1556 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  38.62 
 
 
2651 aa  256  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 
2752 aa  256  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5730  peptide synthetase  37.17 
 
 
1327 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  40.84 
 
 
6999 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  37.3 
 
 
1110 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  36.63 
 
 
13537 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.6 
 
 
1786 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  40.04 
 
 
4290 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  35.81 
 
 
2877 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 
2386 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.5 
 
 
6676 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.45 
 
 
3235 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.77 
 
 
4960 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.62 
 
 
1556 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  41.3 
 
 
1806 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3051  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
1457 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690626  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  35.4 
 
 
3404 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  35.57 
 
 
2875 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  32.67 
 
 
2581 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  40.08 
 
 
3219 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
5620 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.7 
 
 
4342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  41.87 
 
 
3247 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.2 
 
 
2386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  40.04 
 
 
1506 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.45 
 
 
4336 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.3 
 
 
4342 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 
2820 aa  253  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  33.27 
 
 
1093 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.06 
 
 
5149 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  32.65 
 
 
888 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  37.84 
 
 
5422 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.7 
 
 
5953 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.93 
 
 
1550 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4808  amino acid adenylation domain protein  35.16 
 
 
1329 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>