21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2822 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2822  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.13 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.6 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1012  phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>