More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2487 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
377 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  48.18 
 
 
574 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  47.1 
 
 
626 aa  235  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  46.35 
 
 
561 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  43.24 
 
 
1358 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  46.1 
 
 
586 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  41.59 
 
 
583 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  45.45 
 
 
664 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 
618 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  43.77 
 
 
566 aa  209  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  41.67 
 
 
519 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  47.62 
 
 
1108 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
530 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
622 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 
661 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.38 
 
 
647 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.95 
 
 
664 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
444 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.75 
 
 
681 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.7 
 
 
527 aa  192  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  45.1 
 
 
484 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.07 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  41.79 
 
 
625 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  46.48 
 
 
604 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.48 
 
 
584 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  46.48 
 
 
604 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  46.48 
 
 
604 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  40.89 
 
 
626 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.13 
 
 
598 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  40.71 
 
 
625 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3625  protein kinase  40.07 
 
 
665 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160356  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  41.72 
 
 
668 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  35.9 
 
 
634 aa  186  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  38.85 
 
 
618 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
625 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
624 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.37 
 
 
603 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 
567 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
624 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 
624 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  36.42 
 
 
604 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 
668 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
464 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  40.66 
 
 
661 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
700 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
541 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.78 
 
 
676 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  37.9 
 
 
609 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  44.07 
 
 
659 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  46.33 
 
 
522 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  46.33 
 
 
522 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  46.33 
 
 
522 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.98 
 
 
602 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  35.74 
 
 
623 aa  179  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  44.16 
 
 
518 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
628 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.61 
 
 
511 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  35.56 
 
 
614 aa  179  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.67 
 
 
653 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
666 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.63 
 
 
635 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  46.97 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 
763 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 
615 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.54 
 
 
594 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
650 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3381  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 
289 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  43 
 
 
513 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
475 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.66 
 
 
627 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
571 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.77 
 
 
703 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
695 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.82 
 
 
627 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  42.97 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
653 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
862 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 
651 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  41.2 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  32.38 
 
 
641 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 
517 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  37.02 
 
 
625 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  39.35 
 
 
582 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  40.22 
 
 
597 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  41.89 
 
 
436 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  39.78 
 
 
599 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.05 
 
 
681 aa  172  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
612 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.85 
 
 
601 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
565 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  38.97 
 
 
1032 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 
632 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 
419 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
790 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  40.37 
 
 
951 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  41.89 
 
 
431 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  38.97 
 
 
1032 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>