151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2236 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2236  aldo/keto reductase  100 
 
 		 304 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22060  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  62.34 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1925  aldo/keto reductase  52.72 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251191  normal  0.483599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1104  aldo/keto reductase  51.75 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3196  aldo/keto reductase  51.11 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3291  aldo/keto reductase  51.11 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.343705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3096  aldo/keto reductase  50.16 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0474287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2955  aldo/keto reductase  51.28 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2974  aldo/keto reductase  53.7 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118677  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0134  aldo/keto reductase  53.25 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165242  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1756  aldo/keto reductase  51.6 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7472  aldo/keto reductase  53.85 
 
 		 324 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1947  oxidoreductase  37.85 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.561644  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  27.6 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  27.88 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4101  putative aldo-keto reductase  26.81 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000408733  hitchhiker  0.00103859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02682  predicted oxidoreductase, NADP(H)-dependent aldo-keto reductase  26.81 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0856  aldo/keto reductase  26.81 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00288116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02643  hypothetical protein  26.81 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3236  putative aldo-keto reductase  26.35 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0896684  hitchhiker  0.000000643826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3221  putative aldo-keto reductase  26.35 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  hitchhiker  0.000238185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3173  putative aldo-keto reductase  26.35 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.981924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3155  putative aldo-keto reductase  26.35 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0659763  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3336  putative aldo-keto reductase  26.35 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.697041  normal  0.0101445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3028  putative aldo-keto reductase  26.18 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000422385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3154  putative aldo-keto reductase  26.5 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000682822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0881  putative aldo-keto reductase  26.5 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0848488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0672  aldo/keto reductase  27.84 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2981  putative aldo-keto reductase  26.5 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2982  putative aldo-keto reductase  26.5 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0288207  normal  0.0122492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3022  putative aldo-keto reductase  26.56 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0156973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2284  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  26.95 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  28.28 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  30.14 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1488  aldo/keto reductase  26.56 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2569  aldo/keto reductase  26.88 
 
 		 344 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133654  normal  0.0183091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3243  aldo/keto reductase  26.13 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0743  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357174  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5010  aldo/keto reductase  23.64 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.714816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  26.8 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  26.06 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  23.21 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  24.23 
 
 		 409 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1257  aldo/keto reductase  25.08 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  26.33 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  28.96 
 
 		 370 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  25.48 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2327  aldo/keto reductase  26.01 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3275  putative aldo-keto reductase  23.75 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3073  aldo/keto reductase  26.89 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0979  putative aldo-keto reductase  24.68 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000256881  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3243  putative aldo-keto reductase  24.68 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000690689  normal  0.0202789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1031  putative aldo-keto reductase  24.68 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2573  aldo/keto reductase  25.33 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  34.02 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4695  aldo/keto reductase  25.57 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182273  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  30.29 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  28.4 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.65 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  27.27 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2701  aldo/keto reductase  25.08 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.117556  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  28.76 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1055  aldo/keto reductase  25.24 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  25.56 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  29.59 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  24.18 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  25.67 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  22.7 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3664  aldo/keto reductase  23.91 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.160957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  27.09 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.09 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  24.92 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  26.71 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  24.84 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  27.4 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0511  aldo/keto reductase  21.63 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  28.18 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  28.12 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3126  aldo/keto reductase  20.78 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  23.78 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  24.33 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  29.92 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.16 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  30.21 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0400  aldo/keto reductase  23.64 
 
 		 346 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  26.71 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0900  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.36 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3379  aldo/keto reductase  22.36 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3708  aldo/keto reductase  22.5 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0747  aldo/keto reductase  22.36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.636269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  23.93 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  24.13 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3273  aldo/keto reductase  22.36 
 
 		 346 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1120  aldo/keto reductase  25.64 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00427173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0736  aldo/keto reductase  23.25 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  24.65 
 
 		 374 aa  45.8  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  24.76 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>