50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2138 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2138  carbonic anhydrase  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00878397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  33.84 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  36.32 
 
 		 249 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 252 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  32.83 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  30.1 
 
 		 263 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  37.24 
 
 		 253 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  32.65 
 
 		 259 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  30.61 
 
 		 249 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  32.31 
 
 		 255 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  30.61 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  32.34 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  29.29 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  29.29 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  31.16 
 
 		 481 aa  79  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  26.34 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  29.44 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  28.79 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  26.6 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  29.5 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  26.4 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  27.14 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  30 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  27.27 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  26.4 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  26.63 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  29.14 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  26.11 
 
 		 436 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  26.11 
 
 		 436 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  28.22 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  31.5 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  26.24 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  26.13 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  29.65 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  29.65 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  29.29 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1080  carbonic anhydrase  28.95 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.759573  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  24.24 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1623  carbonate dehydratase  27.27 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  26.23 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  27.04 
 
 		 258 aa  62  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0465  carbonate dehydratase  26.47 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0461  carbonate dehydratase  27.23 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.454779  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  28.75 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  27.54 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  35 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  23.92 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  26.96 
 
 		 614 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>