35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1260 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1260  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  493  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0186  membrane protein-like protein  35.31 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5331  hypothetical protein  36.14 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2852  hypothetical protein  34.51 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1860  membrane protein-like protein  28.96 
 
 		 326 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2795  hypothetical protein  39.92 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.400114  normal  0.154233 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1874  hypothetical protein  35.63 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2657  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000346447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1902  hypothetical protein  21.99 
 
 		 289 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00948912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1541  hypothetical protein  21.99 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00136912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  21.28 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  21.28 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  21.63 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  20.43 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  20.43 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  20.43 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  20.43 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  21.63 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  20.92 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1519  Protein of unknown function DUF1980  22.65 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1601  hypothetical protein  25.36 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1695  membrane protein-like  29.09 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1813  hypothetical protein  22.61 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1763  hypothetical protein  22.73 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1634  hypothetical protein  22.73 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1612  permease  22.61 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4252  hypothetical protein  27.08 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0626578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3566  hypothetical protein  22.41 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.509329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0435  hypothetical protein  28.48 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2647  Protein of unknown function DUF1980  22.81 
 
 		 282 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  23.56 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0583  hypothetical protein  26.2 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1360  hypothetical protein  25.97 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.944769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1480  Protein of unknown function DUF1980  29.41 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1838  hypothetical protein  20.63 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.968121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>