12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2953 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  934    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0311686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2518  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1830 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.14 
 
 		 1633 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1491  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1810 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  20.67 
 
 		 1692 aa  50.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  34.04 
 
 		 591 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  21.84 
 
 		 600 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  19.83 
 
 		 1743 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1577 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1698 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.19 
 
 		 513 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.37 
 
 		 868 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>