181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1381 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1381    100 
 
 
1326 bp  2629    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  85.37 
 
 
984 bp  202  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  85.37 
 
 
963 bp  202  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  85.37 
 
 
981 bp  202  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  85.37 
 
 
1218 bp  202  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  85.12 
 
 
996 bp  194  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  85.12 
 
 
924 bp  194  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  88.57 
 
 
963 bp  188  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  84.71 
 
 
810 bp  186  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  85.45 
 
 
924 bp  182  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  92.68 
 
 
990 bp  172  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02983  transposase  85.5 
 
 
375 bp  167  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  82.46 
 
 
669 bp  153  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04848  ISXoo6 transposase  85.08 
 
 
1020 bp  145  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02541    85.37 
 
 
894 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  85.37 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  82.87 
 
 
969 bp  135  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05555    82.41 
 
 
927 bp  127  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  82.41 
 
 
969 bp  127  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    86.57 
 
 
979 bp  123  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00258  transposase  91.86 
 
 
252 bp  115  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.74334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04728  transposase  91.86 
 
 
150 bp  115  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  85.82 
 
 
981 bp  115  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  85.82 
 
 
981 bp  115  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  85.82 
 
 
981 bp  115  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  85.82 
 
 
981 bp  115  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  82.83 
 
 
579 bp  107  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  84 
 
 
963 bp  107  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  83.89 
 
 
984 bp  105  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  84.4 
 
 
960 bp  105  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  83.66 
 
 
960 bp  105  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  83.66 
 
 
960 bp  105  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    85.82 
 
 
602 bp  99.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  83.97 
 
 
981 bp  93.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03449  transposase  86.46 
 
 
210 bp  87.7  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24610  Transposase, IS4  85.05 
 
 
144 bp  85.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4648  transposase, IS4 family protein  90.14 
 
 
705 bp  85.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.818744  normal  0.900302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  82.52 
 
 
960 bp  85.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  96 
 
 
984 bp  83.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  84.26 
 
 
216 bp  79.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03357  ISXoo7 transposase  82.93 
 
 
981 bp  77.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.880653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03464  ISXoo7 transposase  82.93 
 
 
981 bp  77.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  85.11 
 
 
966 bp  75.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  85.11 
 
 
966 bp  75.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  85.11 
 
 
966 bp  75.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  84.16 
 
 
966 bp  73.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0428    82.17 
 
 
459 bp  73.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  87.5 
 
 
981 bp  71.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  88.24 
 
 
669 bp  71.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  82.76 
 
 
735 bp  71.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  81.82 
 
 
984 bp  71.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  82.11 
 
 
981 bp  69.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 
993 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  80.25 
 
 
951 bp  67.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  81.75 
 
 
984 bp  67.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
963 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  95.12 
 
 
981 bp  65.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1014 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1014 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  84.52 
 
 
1050 bp  63.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>