18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0761 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  99.57 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  68.15 
 
 		 145 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5523  hypothetical protein  85.48 
 
 		 101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  43.07 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  91.7  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1029  hypothetical protein  70.83 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  32.84 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  30.94 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  25.35 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  31.96 
 
 		 139 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  25.37 
 
 		 142 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  37.97 
 
 		 135 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>