88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0895 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
349 aa  715    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 
360 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  67.45 
 
 
351 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  67.24 
 
 
355 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  65.44 
 
 
359 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  66.01 
 
 
360 aa  478  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 
356 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  66.1 
 
 
360 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  63.4 
 
 
356 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  63.61 
 
 
357 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  65.41 
 
 
349 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  61.21 
 
 
352 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  64.08 
 
 
349 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  63.51 
 
 
350 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  60.34 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  60.06 
 
 
350 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
350 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  59.59 
 
 
349 aa  433  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  36.7 
 
 
307 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  34.24 
 
 
300 aa  159  8e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  36.9 
 
 
304 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  35.14 
 
 
309 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  35.14 
 
 
309 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  35.14 
 
 
309 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  35.46 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  35.12 
 
 
318 aa  153  4e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  37.17 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  35.14 
 
 
309 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  35.81 
 
 
309 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  33.56 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  32.44 
 
 
301 aa  146  5e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  34.82 
 
 
309 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  35.35 
 
 
310 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.58 
 
 
266 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  26.12 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  24.01 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  26.15 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  27.89 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  25.45 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  24.83 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  23.97 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  27.07 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  25.35 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  24.83 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  23.55 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  25.5 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  26.48 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  25.51 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  23.89 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  24.58 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  25.34 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  22.07 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  26.18 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  22.07 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  23.45 
 
 
260 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  28.9 
 
 
265 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  24.53 
 
 
260 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  24.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  23.37 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  24.4 
 
 
285 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  25.6 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  26.62 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  23.7 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  21.97 
 
 
261 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  23.7 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  26.74 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  21.84 
 
 
268 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  26.44 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  23.44 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  23.37 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.86 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  25.6 
 
 
267 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  27.98 
 
 
262 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  23.26 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  21.76 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  22.93 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  23.88 
 
 
264 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  24.06 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  21.8 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  21.33 
 
 
272 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>