92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0194 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.78 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.85 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.06 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.06 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.84 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.45 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.84 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.84 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.84 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.08 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.65 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  50.56 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  51.69 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  53.26 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.46 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  56 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.48 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.27 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.96 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  49.47 
 
 		 99 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.89 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.89 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.35 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.34 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  43.4 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  49.33 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  50.68 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  43.75 
 
 		 120 aa  87  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  42.11 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  47.44 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  43.42 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.44 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.88 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  36.76 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2426  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  34.85 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1596  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.51 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1993  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.53 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13473  hypothetical protein  30.11 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.928453  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0785  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.11 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23751  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.21 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878237 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0698  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.11 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1065  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.39 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.140967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.12 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0018  hypothetical protein  31.94 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.313448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.77 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  35.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1758  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.69 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2586  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.69 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1263  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.92 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.692203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30210  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.69 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2368  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.65 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2268  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.65 
 
 		 106 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0673  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.58 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3614  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.56 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.51 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.56 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3413  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.56 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1678  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.98 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1824  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.56 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.507725  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.56 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.39 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.954585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1499  ATP-dependent Clp protease adapter protein  26.98 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000467739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1401  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.12 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3261  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.36 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000957927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4494  ATP-dependent Clp protease adaptor  31.11 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2607  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.88 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1600  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.88 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2693  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.88 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3094  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.77 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3354  hypothetical protein  26.56 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.042088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.15 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2441  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.69 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0386  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2057  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.33 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0497269  normal  0.357929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1977  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.31 
 
 		 106 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0713  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.24 
 
 		 106 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01566  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.31 
 
 		 106 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1711  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.31 
 
 		 106 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.461096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.06 
 
 		 106 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  24.62 
 
 		 106 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>