61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1641 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  100 
 
 
147 aa  300  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  97.96 
 
 
147 aa  295  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  97.28 
 
 
147 aa  292  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  65.54 
 
 
148 aa  205  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  32.76 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1938  hypothetical protein  30.97 
 
 
218 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.788927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  28.77 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  32.37 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  32.31 
 
 
145 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  30.09 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  30.47 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  26.36 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  30.43 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  26.27 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  27.66 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  31.73 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  27.61 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  27.93 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  26.17 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  25.77 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  29.57 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  28.37 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  27.72 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  28.28 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  29.67 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  27.35 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  24.44 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  34.48 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  25.77 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  24.78 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  34.48 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  25.49 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  26.6 
 
 
145 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  23.97 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  26.5 
 
 
148 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  26.5 
 
 
148 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  26.6 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  28.21 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0504  cyclase/dehydrase  24 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  26.26 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  23.89 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  23.89 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  23.89 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  23.89 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>