28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1485 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1485  D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.746586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2470  cobalamin B12-binding domain protein  96.86 
 
 
255 aa  477  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2382  cobalamin B12-binding domain protein  97.25 
 
 
255 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2347  cobalamin vitamin B12-binding protein  87.84 
 
 
255 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131121  normal  0.450536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1905  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit, D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  51.06 
 
 
246 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1085  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.72 
 
 
265 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0202  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.07 
 
 
261 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0222678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1074  D-lysine 5,6-aminomutase, beta subunit  48.76 
 
 
263 aa  236  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.439599 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0197  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.5 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3887  cobalamin B12-binding  48.32 
 
 
251 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3949  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.92 
 
 
248 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645556  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2385  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.12 
 
 
254 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00814735  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2347  cobalamin B12-binding domain protein  45.2 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000783692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2266  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.86 
 
 
260 aa  188  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220263  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2664  beta-lysine 5,6-aminomutase beta subunit / D-lysine 5,6-aminomutase beta subunit  46.86 
 
 
251 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21070  cobalamin B12-binding domain protein  32.38 
 
 
730 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1481  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.15 
 
 
734 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00108773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1642  cobalamin B12-binding domain-containing protein  31.09 
 
 
733 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1170  D-lysine 56-aminomutase alpha subunit  28.57 
 
 
732 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.88369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0909  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.69 
 
 
728 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1170  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  32.16 
 
 
745 aa  85.5  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000101599  decreased coverage  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0729  Methionine synthase  28.82 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.342972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1208  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  27.92 
 
 
210 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116164  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1212  methionine synthase  29.31 
 
 
224 aa  45.4  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.807396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1023  methylaspartate mutase subunit S  29.01 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0266173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2582  Methionine synthase  23.57 
 
 
213 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.242133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1594  methylaspartate mutase, S subunit  31.85 
 
 
146 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2571  cobalamin B12-binding domain protein  28.45 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>