18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0660 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  100 
 
 
255 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  90.62 
 
 
256 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  91.02 
 
 
256 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0704  TonB family protein  51.66 
 
 
253 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149916  normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3471  TonB family protein  31.28 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  27.55 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0026  TonB-dependent receptor, putative  28.49 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.429014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  29.35 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  28.72 
 
 
289 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2107  TonB-like protein  29.58 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.799306  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  31.21 
 
 
324 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  34.88 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  31.08 
 
 
242 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  32.98 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  25.51 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  31.08 
 
 
208 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0565  protein TolA  34.18 
 
 
337 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  31.18 
 
 
341 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>