36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0150 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0150  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.567268  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0157  hypothetical protein  96.97 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0168  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  96.97 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0155  hypothetical protein  72.89 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.206055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1932  PTS family phosphotransferase mannose-specific enzyme IIC  37.5 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.118709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2098  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  25.49 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0687  PTS system PTS, sorbose-specific IIC subunit  28.8 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0430077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0628  PTS sorbose-specific transporter subunit IIC  28.8 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3614  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4448  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601715  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02999  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IIC component of PTS  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3431  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0566  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02950  hypothetical protein  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3324  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific, IIC component  35.16 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3950  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  27.32 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3476  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.24 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.482884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2388  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  36.56 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3574  phosphotransferase system PTS, sorbose-specific IIC subunit  36.56 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.579302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0571  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  37.63 
 
 		 133 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4892  PTS system transporter subunit IIC  35.45 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0152  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  35.92 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4951  PTS system transporter subunit IIC  35.45 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242204  normal  0.340025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4791  phosphotransferase enzyme II C component  35.45 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.499684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4945  phosphotransferase enzyme II C component  35.45 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3846  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  33.02 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3401  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  29.09 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000146496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0991  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  35.64 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3373  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IIC component  35.64 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.906209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0939  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IIC component  35.64 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1065  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  31.25 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.424224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0346  PTS system, IIC component  29.27 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1949  PTS system, IIC component  42.22 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3862  phosphotransferase system PTS sorbose-specific IIC subunit  24.86 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0118  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC  24.68 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197057  decreased coverage  7.59057e-25 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4100  PTS system sorbose-specific iic component  29.51 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.95492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>