22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1371 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1083    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  44.41 
 
 
911 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  40.22 
 
 
1062 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  38.64 
 
 
1080 aa  253  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  43.14 
 
 
1033 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  40 
 
 
1047 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  42.05 
 
 
1058 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  37.95 
 
 
1058 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1599  hypothetical protein  55.17 
 
 
245 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  38.51 
 
 
1072 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0707  hypothetical protein  40.47 
 
 
291 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0151738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0876  Bifunctional DNA primase/polymerase  60 
 
 
599 aa  203  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  31.87 
 
 
799 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0902  hypothetical protein  30.82 
 
 
879 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0714  hypothetical protein  30.82 
 
 
879 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0824  hypothetical protein  32.38 
 
 
879 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.592879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  30.19 
 
 
945 aa  90.5  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0964  hypothetical protein  33.84 
 
 
904 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  33.05 
 
 
945 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  42.55 
 
 
521 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2652  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  37.39 
 
 
571 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>