20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3365 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3365  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 393 aa  807    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.803151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0740  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  36.42 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2250  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 367 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.621052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2723  Radical SAM domain protein  35.33 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7109  Fe-S oxidoreductase  34.09 
 
 		 703 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345593  normal  0.70276 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  26.89 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.71 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>