21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4366 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1023    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  27.78 
 
 
527 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  27.78 
 
 
526 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  26.72 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  28.21 
 
 
530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  28.76 
 
 
477 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  27.61 
 
 
568 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  26.17 
 
 
522 aa  160  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  28.34 
 
 
477 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  26.35 
 
 
525 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  26.36 
 
 
525 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  30.77 
 
 
539 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  30.95 
 
 
527 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  27.22 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  27.14 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  31.02 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  26.53 
 
 
543 aa  54.3  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  29.94 
 
 
505 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  27.17 
 
 
229 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  25.67 
 
 
503 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  25.67 
 
 
478 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>