15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1923 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  31.82 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  31.66 
 
 
833 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4641  hypothetical protein  27.24 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  25.45 
 
 
386 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 
388 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  24.01 
 
 
428 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  22.31 
 
 
489 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  26.59 
 
 
389 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  25.58 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  28.03 
 
 
392 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  30.7 
 
 
516 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  23.81 
 
 
391 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  32.48 
 
 
353 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  26.71 
 
 
363 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>