12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0161 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0161  RDD  100 
 
 		 328 aa  663    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  36.36 
 
 		 167 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  27.34 
 
 		 165 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.11 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  25.9 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  43.28 
 
 		 163 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  35.29 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  28.99 
 
 		 166 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  30.49 
 
 		 196 aa  42.7  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>