36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0419 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0419  putative integral membrane protein  100 
 
 
365 aa  704    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1321  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like  40.78 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0345  protein-S-isoprenylcysteine O-methyltransferase-like protein  33.96 
 
 
126 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.7101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  36.56 
 
 
169 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3805  hypothetical protein  36.89 
 
 
160 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0909  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.11 
 
 
157 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.651251  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0318  hypothetical protein  43.56 
 
 
168 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0673382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2751  hypothetical protein  30.63 
 
 
175 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0716915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1559  hypothetical protein  35.09 
 
 
161 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5190  hypothetical protein  37.17 
 
 
437 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726392  normal  0.528978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3105  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02122  hypothetical protein  35.23 
 
 
137 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2214  hypothetical protein  39.08 
 
 
166 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4951  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.93 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.78 
 
 
215 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0484  hypothetical protein  28.33 
 
 
161 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46610  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000109558  hitchhiker  0.00000145614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  37.5 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.3 
 
 
242 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.67 
 
 
158 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.84 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1260  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.7 
 
 
159 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2616  Transmembrane protein  32.08 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0186317  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0802  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.53 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0739  hypothetical protein  31.33 
 
 
144 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000109316  decreased coverage  0.00117402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  28.33 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4292  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.25 
 
 
158 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155454  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.33 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.33 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  28.33 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 
216 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.74 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.45 
 
 
220 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2033  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  35 
 
 
204 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2118  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  35 
 
 
204 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1081  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  30.17 
 
 
206 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>