23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1485 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1485  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1402  hypothetical protein  37.88 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1444  hypothetical protein  37.08 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1129  hypothetical protein  39.32 
 
 
235 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  0.291752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1315  hypothetical protein  38.01 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3284  hypothetical protein  39.91 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1227  hypothetical protein  38.33 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441921  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2226  hypothetical protein  38.67 
 
 
222 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3909  hypothetical protein  46.1 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3517  hypothetical protein  36.78 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.40608  normal  0.0746864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27660  hypothetical protein  35.93 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1441  hypothetical protein  37.61 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1235  hypothetical protein  32.76 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518209  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2148  hypothetical protein  33.19 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0117779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2207  hypothetical protein  33.19 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0934997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2161  hypothetical protein  33.19 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3984  hypothetical protein  32.03 
 
 
236 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00116122  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1620  hypothetical protein  52.63 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239662  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3963  hypothetical protein  29.44 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311022  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2433  hypothetical protein  31.36 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0549482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2212  hypothetical protein  36.54 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12741  hypothetical protein  28.67 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.39574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1556  hypothetical protein  48.44 
 
 
253 aa  42.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0182059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>