20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1526 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  343  8e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4216  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.141181  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3725  transcriptional regulator, ArsR family  27.55 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  0.384305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 472 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  39.06 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0166  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.789061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1182  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 99 aa  45.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00795875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 117 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 317 aa  44.7  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1437  transcriptional regulator, ArsR family  31.08 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 100 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4017  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.94661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 		 626 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 277 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>