66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1875 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  324  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  50.64 
 
 
164 aa  163  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  38.16 
 
 
159 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  38.31 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  38.31 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  38.31 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  37.66 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  37.5 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  37.66 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  35.53 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  36.18 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  35.71 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  36.13 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  36.13 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  37.5 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  36.13 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  36.13 
 
 
149 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  34.21 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  34.21 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  33.55 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  33.55 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  35.48 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  32.24 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  31.58 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  32.89 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  27.92 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  31.17 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  33.58 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  34.64 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  34 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  30.92 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  29.41 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  29.41 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  30.6 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  28.39 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  28.57 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  30.25 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  30.3 
 
 
177 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  30.14 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  25.56 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  34.34 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  34.88 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  29.22 
 
 
270 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  34.95 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 
300 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
300 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
300 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
300 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  31.06 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  23.03 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
300 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  26.27 
 
 
288 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  28.03 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  26.09 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 
279 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 
300 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  23.9 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
300 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 
279 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
277 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 
298 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
281 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>