43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1160 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1160  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0021  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0042  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0043  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0011  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0017  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.253247  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0010  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.354974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0025  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022777  normal  0.365666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0024  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0005  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.0896223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0003  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.685555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0029  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0056  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0034  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0036  tRNA-Lys  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0286926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00236112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0008  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0558  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0006  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.202736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0653  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2173  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.206805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0006  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.303657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0059  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000193701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21420  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000610932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0031  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0043  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>