299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0021 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0023  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0024  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0024  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0025  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0043  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129549  unclonable  0.000000000302545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0042  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000326877  unclonable  0.000000000331306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0045  tRNA-Lys  94.44 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00000955688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0081  tRNA-Lys  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1400  tRNA-Lys  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524928  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0065  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2736  tRNA-Lys  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000214586  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4226  tRNA-Lys  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108643  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0062  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0068  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437414  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0063  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0067  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0018  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0066  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4253  tRNA-Lys  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.87819e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000173353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4251  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000189937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0078  tRNA-Lys  91.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000025771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0064  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0049  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000590411  decreased coverage  0.00000280751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0080  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000294531  normal 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.31 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4248  tRNA-Lys  92.31 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4247  tRNA-Lys  92.31 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000893076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0056  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000193092  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0024  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143684  normal  0.454789 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06830  tRNA-Lys  92.16 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000622929  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0913  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000921732  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0087  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000568391  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00467  tRNA-Lys  92.16 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0912  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000796391  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0084  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347447  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0910  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000110195  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2653  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000100151  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2611  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000669523  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0819  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  normal  0.860753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0881  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000114507  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00376  tRNA-Lys  92.16 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  92.16 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0025  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148774  normal  0.456967 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  92.16 
 
 
78 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000662129  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0882  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000105642  normal  0.563094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>