14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3466 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  96.48 
 
 		 1193 aa  2209    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  69.46 
 
 		 1162 aa  1618    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  98.74 
 
 		 1192 aa  2244    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1191 aa  2398    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  27.63 
 
 		 1155 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 		 1058 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  23.03 
 
 		 1090 aa  97.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1108 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  25.46 
 
 		 941 aa  79.7  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  24.96 
 
 		 922 aa  73.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  22.13 
 
 		 952 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  20.35 
 
 		 952 aa  52.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  20.49 
 
 		 957 aa  50.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6495  Tetratricopeptide repeat protein  20.34 
 
 		 1202 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>