28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1630 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1630  amidohydrolase  100 
 
 
424 aa  850    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1555  amidohydrolase  91.75 
 
 
424 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.82 
 
 
441 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  27.79 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  23.13 
 
 
433 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  28.29 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  31.03 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  29.89 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.89 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  28.96 
 
 
413 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  22.54 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  22.78 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.33 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
443 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  25.73 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.18 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  29.28 
 
 
414 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  22.7 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  22.14 
 
 
437 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.08 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  26.03 
 
 
480 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.08 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.08 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0963  amidohydrolase  28.57 
 
 
446 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.32 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  28.36 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  25.6 
 
 
431 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  21.97 
 
 
435 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>