24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1132 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1132  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  50.68 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  45.33 
 
 
76 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  54.1 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2471  hypothetical protein  42.47 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0192459 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  38.03 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  46.88 
 
 
80 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  45 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  49.21 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4664  hypothetical protein  40.3 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.203838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  44.07 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  39.68 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  35.06 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  39.06 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  32.43 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5758  hypothetical protein  39.19 
 
 
74 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4640  hypothetical protein  43.86 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  38.03 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0194  hypothetical protein  42.42 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.989566  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1487  hypothetical protein  33.85 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4399  hypothetical protein  45.24 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000669872  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4284  hypothetical protein  40.35 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0055  hypothetical protein  36.99 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>