56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1651 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 
167 aa  348  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  348  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  345  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  77.25 
 
 
167 aa  264  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  60 
 
 
190 aa  223  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  61.21 
 
 
174 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  38.89 
 
 
178 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  39.07 
 
 
396 aa  115  4e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  37.34 
 
 
160 aa  113  1e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  35.53 
 
 
393 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  33.95 
 
 
165 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.16 
 
 
393 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.32 
 
 
403 aa  101  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  38.16 
 
 
393 aa  98.6  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.48 
 
 
392 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  29.81 
 
 
171 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  29.81 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  35.44 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.84 
 
 
393 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  29.81 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  31.9 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  30.43 
 
 
169 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.62 
 
 
392 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  29.81 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  29.19 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 
170 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  28.57 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  28.57 
 
 
170 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  27.95 
 
 
169 aa  84.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  33.56 
 
 
183 aa  81.3  5e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  28.57 
 
 
170 aa  80.9  7e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  27.98 
 
 
182 aa  80.1  1e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.04771e-07  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  28.21 
 
 
178 aa  79  3e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.63018e-10  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  32.12 
 
 
179 aa  76.3  2e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  32.12 
 
 
181 aa  74.3  6e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  32.12 
 
 
181 aa  74.7  6e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  30.66 
 
 
179 aa  73.9  9e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  30.66 
 
 
179 aa  73.9  9e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  33.09 
 
 
177 aa  73.6  1e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  30.66 
 
 
179 aa  73.9  1e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  31.51 
 
 
178 aa  72.8  2e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  30.77 
 
 
178 aa  73.2  2e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  31.54 
 
 
177 aa  71.6  4e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  31.39 
 
 
181 aa  71.6  5e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  30.87 
 
 
177 aa  70.9  7e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  30.66 
 
 
179 aa  66.2  2e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  28.95 
 
 
211 aa  65.1  4e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  24.85 
 
 
182 aa  62.4  3e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  24.85 
 
 
182 aa  62  4e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  24.85 
 
 
182 aa  61.6  4e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  24.85 
 
 
182 aa  61.2  7e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  24.24 
 
 
182 aa  60.5  1e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>