57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0032 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  83.33 
 
 
171 aa  294  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  83.93 
 
 
170 aa  294  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  83.33 
 
 
170 aa  293  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  82.14 
 
 
171 aa  290  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  82.74 
 
 
170 aa  289  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  82.74 
 
 
170 aa  289  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  74.85 
 
 
169 aa  264  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  73.65 
 
 
175 aa  262  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  73.21 
 
 
170 aa  261  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  72.62 
 
 
169 aa  259  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  71.86 
 
 
169 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  70.83 
 
 
170 aa  252  2e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  71.86 
 
 
169 aa  247  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  69.05 
 
 
191 aa  246  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  61.64 
 
 
165 aa  199  1e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  57.63 
 
 
178 aa  198  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.63018e-10  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  57.32 
 
 
178 aa  197  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  58.75 
 
 
160 aa  196  1e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  58.19 
 
 
178 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  58.08 
 
 
167 aa  175  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  47.47 
 
 
396 aa  152  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  49.36 
 
 
392 aa  140  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  46.15 
 
 
393 aa  139  1e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  50 
 
 
392 aa  138  4e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  42.04 
 
 
393 aa  133  1e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  47.13 
 
 
393 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  42.04 
 
 
403 aa  127  9e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  45.86 
 
 
393 aa  119  2e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  30.43 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  29.81 
 
 
174 aa  84  1e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  35.47 
 
 
177 aa  79  3e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2778  formaldehyde-activating domain-containing protein  48.75 
 
 
119 aa  78.6  4e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  36.2 
 
 
181 aa  77.8  6e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  34.93 
 
 
177 aa  77.4  8e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  33.13 
 
 
179 aa  76.6  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  34.94 
 
 
183 aa  76.3  2e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  32.65 
 
 
177 aa  75.9  3e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  29.19 
 
 
167 aa  74.7  6e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  32.12 
 
 
182 aa  74.3  7e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.04771e-07  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  30.43 
 
 
167 aa  73.6  1e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  73.6  1e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  32.88 
 
 
181 aa  73.6  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  72.8  2e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  32.19 
 
 
181 aa  73.2  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  34.11 
 
 
179 aa  72.4  3e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  34.11 
 
 
179 aa  72.4  3e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  31.51 
 
 
179 aa  71.2  7e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  30.82 
 
 
179 aa  70.1  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  32.08 
 
 
391 aa  65.5  3e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  27.67 
 
 
178 aa  64.7  5e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  27.44 
 
 
182 aa  62.4  3e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  27.44 
 
 
182 aa  62  3e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  27.44 
 
 
182 aa  61.2  7e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  27.27 
 
 
211 aa  60.1  1e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  26.22 
 
 
182 aa  58.9  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  26.83 
 
 
182 aa  58.9  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>