25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2889 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  73.98 
 
 
271 aa  427  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  3.99793e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  63.43 
 
 
277 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  47.93 
 
 
263 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 
279 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  32.24 
 
 
371 aa  113  4e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  35.05 
 
 
381 aa  111  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  30.52 
 
 
371 aa  110  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  30.52 
 
 
371 aa  110  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  30.52 
 
 
371 aa  110  2e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  30.58 
 
 
367 aa  108  9e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  30.58 
 
 
367 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  30.58 
 
 
367 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  30.58 
 
 
367 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  28.3 
 
 
369 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  32.09 
 
 
378 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  33.49 
 
 
223 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  35.32 
 
 
235 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  29.39 
 
 
228 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  30.05 
 
 
376 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  31.63 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  31.63 
 
 
235 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  30.12 
 
 
221 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  25.17 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  26.8 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>