32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1165 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1165  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1005  hypothetical protein  58.24 
 
 
92 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1089  hypothetical protein  56.18 
 
 
92 aa  114  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1528  hypothetical protein  60.22 
 
 
94 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1935  hypothetical protein  65.48 
 
 
95 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.235684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4300  hypothetical protein  67.65 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.486279  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2823  hypothetical protein  57.89 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3777  hypothetical protein  56.34 
 
 
86 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2780  hypothetical protein  51.49 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198014  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2774  hypothetical protein  48 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0718  hypothetical protein  42.86 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.388417  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2473  hypothetical protein  45.21 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121534  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1109  putative lipoprotein transmembrane  36.92 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.862439  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1202  lipoprotein transmembrane  35.38 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1281  lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0429842  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0638  hypothetical protein  33.8 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0105694  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1282  FixH family protein  38.46 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1965  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0441287  hitchhiker  0.00747997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2010  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.7151  hitchhiker  0.0000000218476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2111  hypothetical protein  43.4 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125675  normal  0.439118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2360  hypothetical protein  41.51 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1955  hypothetical protein  42.31 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1847  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.227491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1997  hypothetical protein  31.88 
 
 
178 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.591704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2036  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2216  hypothetical protein  40.38 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316699  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2218  FixH family protein  38.46 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000107723  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2166  hypothetical protein  40.38 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000514786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2205  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4491  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3420  hypothetical protein  29.73 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.300528  normal  0.0548017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2014  hypothetical protein  38.46 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0149983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>