52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0018 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  59.43 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3208  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2559  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5311  GCN5-related N-acetyltransferase  30.8 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3732  GCN5-related N-acetyltransferase  29.54 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.311984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10739  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4371  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2290  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4142  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0580  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353174  hitchhiker  0.0086157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0558  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1137  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 418 aa  52.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5486  FR47 domain-containing protein  36.67 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359302  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08970  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.25 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5596  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697778  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 		 150 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.84 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  29.39 
 
 		 477 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11380  predicted acyltransferase  31.72 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2053  FR47 domain protein  36.36 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 		 345 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0547  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0679  putative acetyltransferase  39.02 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1546  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3797  FR47 domain protein  35.05 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.848679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4007  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0945133  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6287  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.53 
 
 		 161 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3537  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  27.31 
 
 		 271 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000110106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3828  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 268 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.86874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>